Protein–RNA interactions for Protein: P68104

EEF1A1, Elongation factor 1-alpha 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P68104 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EEF1A1P68104 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1A1P68104 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1A1P68104 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1A1P68104 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1A1P68104 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1A1P68104 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1A1P68104 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1A1P68104 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1A1P68104 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1A1P68104 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1A1P68104 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1A1P68104 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1A1P68104 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1A1P68104 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1A1P68104 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1A1P68104 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1A1P68104 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1A1P68104 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EEF1A1P68104 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
EEF1A1P68104 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
EEF1A1P68104 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EEF1A1P68104 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms