Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERVK_113P63121 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms