Protein–RNA interactions for Protein: P62877

RBX1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBX1P62877 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBX1P62877 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBX1P62877 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBX1P62877 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBX1P62877 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBX1P62877 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBX1P62877 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBX1P62877 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBX1P62877 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBX1P62877 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBX1P62877 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBX1P62877 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBX1P62877 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBX1P62877 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBX1P62877 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBX1P62877 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBX1P62877 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBX1P62877 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RBX1P62877 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBX1P62877 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBX1P62877 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBX1P62877 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RBX1P62877 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBX1P62877 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBX1P62877 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBX1P62877 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBX1P62877 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBX1P62877 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBX1P62877 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBX1P62877 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBX1P62877 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBX1P62877 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBX1P62877 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBX1P62877 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBX1P62877 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBX1P62877 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBX1P62877 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBX1P62877 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBX1P62877 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBX1P62877 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBX1P62877 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBX1P62877 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBX1P62877 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBX1P62877 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBX1P62877 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBX1P62877 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBX1P62877 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBX1P62877 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBX1P62877 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBX1P62877 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBX1P62877 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBX1P62877 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBX1P62877 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBX1P62877 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RBX1P62877 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBX1P62877 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBX1P62877 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBX1P62877 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBX1P62877 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBX1P62877 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBX1P62877 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBX1P62877 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBX1P62877 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBX1P62877 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBX1P62877 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBX1P62877 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBX1P62877 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBX1P62877 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBX1P62877 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBX1P62877 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBX1P62877 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RBX1P62877 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBX1P62877 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RBX1P62877 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBX1P62877 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBX1P62877 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBX1P62877 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBX1P62877 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBX1P62877 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBX1P62877 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBX1P62877 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBX1P62877 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBX1P62877 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBX1P62877 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBX1P62877 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBX1P62877 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBX1P62877 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBX1P62877 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBX1P62877 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBX1P62877 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBX1P62877 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBX1P62877 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBX1P62877 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBX1P62877 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBX1P62877 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBX1P62877 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBX1P62877 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RBX1P62877 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBX1P62877 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBX1P62877 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms