Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARF6P62330 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARF6P62330 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARF6P62330 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARF6P62330 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ARF6P62330 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ARF6P62330 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ARF6P62330 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARF6P62330 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARF6P62330 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARF6P62330 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ARF6P62330 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARF6P62330 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARF6P62330 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ARF6P62330 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARF6P62330 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ARF6P62330 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARF6P62330 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARF6P62330 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARF6P62330 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARF6P62330 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARF6P62330 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARF6P62330 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARF6P62330 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARF6P62330 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARF6P62330 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARF6P62330 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARF6P62330 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARF6P62330 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARF6P62330 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARF6P62330 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ARF6P62330 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARF6P62330 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARF6P62330 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARF6P62330 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARF6P62330 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARF6P62330 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARF6P62330 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARF6P62330 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ARF6P62330 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ARF6P62330 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARF6P62330 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ARF6P62330 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARF6P62330 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARF6P62330 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARF6P62330 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARF6P62330 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARF6P62330 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARF6P62330 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARF6P62330 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARF6P62330 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ARF6P62330 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ARF6P62330 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARF6P62330 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARF6P62330 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARF6P62330 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ARF6P62330 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARF6P62330 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARF6P62330 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARF6P62330 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARF6P62330 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ARF6P62330 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARF6P62330 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARF6P62330 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARF6P62330 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARF6P62330 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARF6P62330 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARF6P62330 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARF6P62330 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARF6P62330 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARF6P62330 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ARF6P62330 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ARF6P62330 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ARF6P62330 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARF6P62330 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARF6P62330 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARF6P62330 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARF6P62330 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARF6P62330 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARF6P62330 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARF6P62330 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARF6P62330 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARF6P62330 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARF6P62330 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARF6P62330 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARF6P62330 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARF6P62330 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARF6P62330 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARF6P62330 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARF6P62330 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARF6P62330 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARF6P62330 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ARF6P62330 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARF6P62330 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARF6P62330 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARF6P62330 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARF6P62330 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARF6P62330 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARF6P62330 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ARF6P62330 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms