Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPD1P62314 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPD1P62314 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms