Protein–RNA interactions for Protein: P61586

RHOA, Transforming protein RhoA, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOAP61586 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOAP61586 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOAP61586 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOAP61586 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOAP61586 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOAP61586 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOAP61586 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOAP61586 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOAP61586 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOAP61586 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOAP61586 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHOAP61586 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOAP61586 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOAP61586 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOAP61586 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOAP61586 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOAP61586 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOAP61586 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOAP61586 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOAP61586 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOAP61586 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOAP61586 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOAP61586 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOAP61586 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOAP61586 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOAP61586 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOAP61586 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOAP61586 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOAP61586 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOAP61586 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOAP61586 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOAP61586 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOAP61586 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOAP61586 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOAP61586 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOAP61586 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOAP61586 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOAP61586 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOAP61586 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOAP61586 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOAP61586 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOAP61586 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOAP61586 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOAP61586 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOAP61586 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOAP61586 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOAP61586 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOAP61586 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOAP61586 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOAP61586 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOAP61586 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOAP61586 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOAP61586 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOAP61586 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOAP61586 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOAP61586 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOAP61586 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOAP61586 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOAP61586 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOAP61586 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOAP61586 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOAP61586 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOAP61586 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOAP61586 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOAP61586 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOAP61586 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOAP61586 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOAP61586 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOAP61586 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOAP61586 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOAP61586 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOAP61586 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOAP61586 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOAP61586 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOAP61586 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOAP61586 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOAP61586 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOAP61586 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOAP61586 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOAP61586 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOAP61586 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOAP61586 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOAP61586 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOAP61586 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOAP61586 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOAP61586 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOAP61586 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOAP61586 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOAP61586 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOAP61586 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOAP61586 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOAP61586 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOAP61586 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHOAP61586 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHOAP61586 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHOAP61586 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHOAP61586 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOAP61586 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOAP61586 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOAP61586 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms