Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERVK_113P61574 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms