Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVS71-1P61550 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVS71-1P61550 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms