Protein–RNA interactions for Protein: P60484

PTEN, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP60484 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTENP60484 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTENP60484 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTENP60484 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTENP60484 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTENP60484 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTENP60484 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTENP60484 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTENP60484 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTENP60484 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTENP60484 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTENP60484 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTENP60484 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTENP60484 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTENP60484 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PTENP60484 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTENP60484 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTENP60484 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTENP60484 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTENP60484 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTENP60484 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTENP60484 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTENP60484 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTENP60484 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTENP60484 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTENP60484 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTENP60484 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTENP60484 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTENP60484 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTENP60484 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTENP60484 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTENP60484 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTENP60484 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTENP60484 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTENP60484 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTENP60484 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTENP60484 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTENP60484 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTENP60484 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTENP60484 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTENP60484 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTENP60484 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTENP60484 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTENP60484 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTENP60484 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTENP60484 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTENP60484 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTENP60484 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTENP60484 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTENP60484 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTENP60484 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTENP60484 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTENP60484 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTENP60484 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTENP60484 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PTENP60484 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTENP60484 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTENP60484 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTENP60484 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTENP60484 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PTENP60484 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTENP60484 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTENP60484 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTENP60484 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTENP60484 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTENP60484 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTENP60484 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTENP60484 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTENP60484 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTENP60484 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTENP60484 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTENP60484 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTENP60484 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTENP60484 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTENP60484 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTENP60484 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTENP60484 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTENP60484 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTENP60484 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTENP60484 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTENP60484 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTENP60484 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTENP60484 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTENP60484 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTENP60484 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTENP60484 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTENP60484 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTENP60484 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTENP60484 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTENP60484 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTENP60484 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTENP60484 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTENP60484 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTENP60484 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTENP60484 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTENP60484 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTENP60484 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTENP60484 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTENP60484 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PTENP60484 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms