Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCCD1P59942 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms