Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM3BP58499 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM3BP58499 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms