Protein–RNA interactions for Protein: P57060

RWDD2B, RWD domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2BP57060 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RWDD2BP57060 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RWDD2BP57060 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms