Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
H2BFSP57053 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2BFSP57053 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms