Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX17P56962 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX17P56962 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
STX17P56962 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX17P56962 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX17P56962 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX17P56962 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX17P56962 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX17P56962 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX17P56962 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX17P56962 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX17P56962 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STX17P56962 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STX17P56962 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STX17P56962 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STX17P56962 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STX17P56962 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STX17P56962 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STX17P56962 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STX17P56962 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STX17P56962 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STX17P56962 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STX17P56962 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STX17P56962 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STX17P56962 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STX17P56962 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STX17P56962 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STX17P56962 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STX17P56962 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STX17P56962 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STX17P56962 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STX17P56962 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STX17P56962 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STX17P56962 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STX17P56962 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STX17P56962 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STX17P56962 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STX17P56962 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STX17P56962 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
STX17P56962 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
STX17P56962 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STX17P56962 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STX17P56962 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STX17P56962 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STX17P56962 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STX17P56962 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STX17P56962 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STX17P56962 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STX17P56962 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
STX17P56962 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
STX17P56962 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STX17P56962 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STX17P56962 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STX17P56962 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STX17P56962 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STX17P56962 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STX17P56962 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STX17P56962 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STX17P56962 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STX17P56962 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STX17P56962 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STX17P56962 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STX17P56962 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STX17P56962 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STX17P56962 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STX17P56962 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STX17P56962 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STX17P56962 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STX17P56962 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STX17P56962 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STX17P56962 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STX17P56962 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STX17P56962 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STX17P56962 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STX17P56962 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STX17P56962 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STX17P56962 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STX17P56962 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STX17P56962 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STX17P56962 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STX17P56962 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STX17P56962 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STX17P56962 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
STX17P56962 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
STX17P56962 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STX17P56962 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STX17P56962 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STX17P56962 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STX17P56962 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STX17P56962 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STX17P56962 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STX17P56962 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STX17P56962 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STX17P56962 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STX17P56962 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
STX17P56962 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STX17P56962 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STX17P56962 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STX17P56962 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STX17P56962 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms