Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC4P56524 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC4P56524 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC4P56524 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC4P56524 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC4P56524 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC4P56524 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC4P56524 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC4P56524 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC4P56524 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC4P56524 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC4P56524 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC4P56524 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC4P56524 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC4P56524 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC4P56524 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC4P56524 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC4P56524 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC4P56524 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC4P56524 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC4P56524 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC4P56524 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC4P56524 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC4P56524 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC4P56524 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC4P56524 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC4P56524 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC4P56524 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC4P56524 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC4P56524 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC4P56524 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC4P56524 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC4P56524 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC4P56524 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC4P56524 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC4P56524 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC4P56524 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms