Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP1S2P56377 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP1S2P56377 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP1S2P56377 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP1S2P56377 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
AP1S2P56377 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP1S2P56377 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP1S2P56377 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP1S2P56377 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP1S2P56377 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP1S2P56377 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP1S2P56377 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP1S2P56377 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP1S2P56377 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP1S2P56377 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP1S2P56377 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP1S2P56377 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
AP1S2P56377 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP1S2P56377 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP1S2P56377 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP1S2P56377 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP1S2P56377 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP1S2P56377 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP1S2P56377 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
AP1S2P56377 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AP1S2P56377 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms