Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP1P56182 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP1P56182 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP1P56182 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP1P56182 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP1P56182 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP1P56182 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP1P56182 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP1P56182 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRP1P56182 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRP1P56182 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRP1P56182 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRP1P56182 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
RRP1P56182 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRP1P56182 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRP1P56182 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRP1P56182 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRP1P56182 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRP1P56182 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRP1P56182 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRP1P56182 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP1P56182 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP1P56182 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP1P56182 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP1P56182 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP1P56182 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP1P56182 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRP1P56182 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRP1P56182 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRP1P56182 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRP1P56182 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRP1P56182 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRP1P56182 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRP1P56182 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRP1P56182 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRP1P56182 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRP1P56182 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRP1P56182 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRP1P56182 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRP1P56182 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRP1P56182 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRP1P56182 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRP1P56182 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RRP1P56182 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRP1P56182 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRP1P56182 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRP1P56182 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRP1P56182 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRP1P56182 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRP1P56182 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP1P56182 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP1P56182 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP1P56182 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP1P56182 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP1P56182 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP1P56182 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP1P56182 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP1P56182 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP1P56182 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP1P56182 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP1P56182 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP1P56182 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRP1P56182 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRP1P56182 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRP1P56182 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RRP1P56182 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRP1P56182 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRP1P56182 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRP1P56182 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRP1P56182 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRP1P56182 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRP1P56182 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP1P56182 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP1P56182 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP1P56182 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP1P56182 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP1P56182 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP1P56182 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP1P56182 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP1P56182 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP1P56182 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP1P56182 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP1P56182 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP1P56182 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP1P56182 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP1P56182 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP1P56182 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP1P56182 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRP1P56182 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRP1P56182 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRP1P56182 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRP1P56182 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRP1P56182 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRP1P56182 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRP1P56182 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRP1P56182 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRP1P56182 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRP1P56182 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RRP1P56182 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RRP1P56182 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms