Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCL23P55773 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCL23P55773 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCL23P55773 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCL23P55773 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCL23P55773 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCL23P55773 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCL23P55773 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCL23P55773 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCL23P55773 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCL23P55773 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCL23P55773 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCL23P55773 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCL23P55773 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCL23P55773 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCL23P55773 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCL23P55773 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCL23P55773 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCL23P55773 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCL23P55773 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCL23P55773 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCL23P55773 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCL23P55773 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCL23P55773 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCL23P55773 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCL23P55773 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCL23P55773 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCL23P55773 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCL23P55773 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCL23P55773 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCL23P55773 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCL23P55773 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCL23P55773 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCL23P55773 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCL23P55773 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCL23P55773 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCL23P55773 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCL23P55773 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCL23P55773 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCL23P55773 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCL23P55773 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCL23P55773 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCL23P55773 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCL23P55773 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCL23P55773 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCL23P55773 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCL23P55773 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCL23P55773 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCL23P55773 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCL23P55773 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCL23P55773 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCL23P55773 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCL23P55773 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCL23P55773 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCL23P55773 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCL23P55773 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCL23P55773 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCL23P55773 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCL23P55773 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCL23P55773 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCL23P55773 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCL23P55773 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCL23P55773 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCL23P55773 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCL23P55773 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCL23P55773 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCL23P55773 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCL23P55773 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCL23P55773 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCL23P55773 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCL23P55773 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCL23P55773 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCL23P55773 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCL23P55773 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCL23P55773 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCL23P55773 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCL23P55773 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCL23P55773 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCL23P55773 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCL23P55773 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCL23P55773 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCL23P55773 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCL23P55773 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCL23P55773 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCL23P55773 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCL23P55773 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCL23P55773 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCL23P55773 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCL23P55773 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCL23P55773 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCL23P55773 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCL23P55773 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCL23P55773 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCL23P55773 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCL23P55773 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCL23P55773 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCL23P55773 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCL23P55773 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCL23P55773 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCL23P55773 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms