Protein–RNA interactions for Protein: P55145

MANF, Mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MANFP55145 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MANFP55145 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MANFP55145 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MANFP55145 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MANFP55145 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MANFP55145 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MANFP55145 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MANFP55145 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MANFP55145 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MANFP55145 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MANFP55145 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MANFP55145 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MANFP55145 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MANFP55145 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MANFP55145 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MANFP55145 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MANFP55145 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MANFP55145 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MANFP55145 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MANFP55145 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MANFP55145 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MANFP55145 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MANFP55145 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MANFP55145 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MANFP55145 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MANFP55145 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MANFP55145 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MANFP55145 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MANFP55145 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MANFP55145 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MANFP55145 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MANFP55145 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MANFP55145 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MANFP55145 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MANFP55145 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MANFP55145 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MANFP55145 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MANFP55145 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MANFP55145 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MANFP55145 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MANFP55145 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MANFP55145 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MANFP55145 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MANFP55145 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MANFP55145 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MANFP55145 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MANFP55145 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MANFP55145 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MANFP55145 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MANFP55145 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MANFP55145 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MANFP55145 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MANFP55145 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MANFP55145 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MANFP55145 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MANFP55145 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MANFP55145 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MANFP55145 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MANFP55145 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MANFP55145 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MANFP55145 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MANFP55145 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MANFP55145 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MANFP55145 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MANFP55145 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MANFP55145 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MANFP55145 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MANFP55145 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MANFP55145 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MANFP55145 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MANFP55145 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MANFP55145 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MANFP55145 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MANFP55145 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MANFP55145 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MANFP55145 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MANFP55145 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MANFP55145 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MANFP55145 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MANFP55145 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MANFP55145 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MANFP55145 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MANFP55145 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MANFP55145 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MANFP55145 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MANFP55145 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MANFP55145 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MANFP55145 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MANFP55145 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MANFP55145 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MANFP55145 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MANFP55145 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MANFP55145 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MANFP55145 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MANFP55145 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MANFP55145 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MANFP55145 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MANFP55145 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MANFP55145 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MANFP55145 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms