Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EMP1P54849 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EMP1P54849 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EMP1P54849 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EMP1P54849 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EMP1P54849 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EMP1P54849 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EMP1P54849 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EMP1P54849 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EMP1P54849 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EMP1P54849 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EMP1P54849 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EMP1P54849 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EMP1P54849 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EMP1P54849 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EMP1P54849 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EMP1P54849 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EMP1P54849 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EMP1P54849 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EMP1P54849 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EMP1P54849 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EMP1P54849 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EMP1P54849 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EMP1P54849 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EMP1P54849 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EMP1P54849 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EMP1P54849 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EMP1P54849 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EMP1P54849 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EMP1P54849 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EMP1P54849 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EMP1P54849 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EMP1P54849 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EMP1P54849 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EMP1P54849 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EMP1P54849 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EMP1P54849 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EMP1P54849 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EMP1P54849 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EMP1P54849 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMP1P54849 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMP1P54849 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMP1P54849 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMP1P54849 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMP1P54849 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMP1P54849 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMP1P54849 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMP1P54849 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMP1P54849 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMP1P54849 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMP1P54849 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMP1P54849 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMP1P54849 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMP1P54849 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMP1P54849 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMP1P54849 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMP1P54849 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMP1P54849 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMP1P54849 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMP1P54849 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMP1P54849 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMP1P54849 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EMP1P54849 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EMP1P54849 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EMP1P54849 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EMP1P54849 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EMP1P54849 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EMP1P54849 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EMP1P54849 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EMP1P54849 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EMP1P54849 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EMP1P54849 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EMP1P54849 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP1P54849 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP1P54849 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP1P54849 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP1P54849 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP1P54849 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP1P54849 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP1P54849 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP1P54849 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP1P54849 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP1P54849 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP1P54849 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP1P54849 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP1P54849 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP1P54849 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP1P54849 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP1P54849 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EMP1P54849 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP1P54849 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP1P54849 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP1P54849 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP1P54849 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP1P54849 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP1P54849 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP1P54849 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP1P54849 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP1P54849 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EMP1P54849 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms