Protein–RNA interactions for Protein: P54577

YARS, Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YARSP54577 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
YARSP54577 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YARSP54577 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YARSP54577 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
YARSP54577 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
YARSP54577 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YARSP54577 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YARSP54577 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
YARSP54577 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YARSP54577 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
YARSP54577 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YARSP54577 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YARSP54577 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
YARSP54577 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
YARSP54577 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
YARSP54577 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YARSP54577 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YARSP54577 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YARSP54577 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YARSP54577 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
YARSP54577 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
YARSP54577 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
YARSP54577 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
YARSP54577 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
YARSP54577 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
YARSP54577 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
YARSP54577 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
YARSP54577 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
YARSP54577 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
YARSP54577 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
YARSP54577 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
YARSP54577 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
YARSP54577 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
YARSP54577 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
YARSP54577 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
YARSP54577 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YARSP54577 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YARSP54577 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YARSP54577 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YARSP54577 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
YARSP54577 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YARSP54577 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YARSP54577 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
YARSP54577 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YARSP54577 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YARSP54577 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YARSP54577 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YARSP54577 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YARSP54577 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YARSP54577 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YARSP54577 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YARSP54577 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YARSP54577 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YARSP54577 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YARSP54577 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YARSP54577 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YARSP54577 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YARSP54577 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YARSP54577 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YARSP54577 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
YARSP54577 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
YARSP54577 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
YARSP54577 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YARSP54577 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
YARSP54577 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YARSP54577 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YARSP54577 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YARSP54577 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YARSP54577 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
YARSP54577 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YARSP54577 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YARSP54577 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
YARSP54577 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YARSP54577 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YARSP54577 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YARSP54577 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YARSP54577 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YARSP54577 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
YARSP54577 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
YARSP54577 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
YARSP54577 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YARSP54577 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YARSP54577 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YARSP54577 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YARSP54577 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YARSP54577 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
YARSP54577 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
YARSP54577 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
YARSP54577 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
YARSP54577 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YARSP54577 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YARSP54577 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
YARSP54577 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
YARSP54577 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
YARSP54577 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YARSP54577 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
YARSP54577 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YARSP54577 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YARSP54577 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YARSP54577 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms