Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FOSBP53539 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FOSBP53539 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FOSBP53539 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOSBP53539 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOSBP53539 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOSBP53539 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOSBP53539 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOSBP53539 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
FOSBP53539 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOSBP53539 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOSBP53539 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOSBP53539 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOSBP53539 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOSBP53539 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOSBP53539 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOSBP53539 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOSBP53539 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOSBP53539 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOSBP53539 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOSBP53539 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOSBP53539 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOSBP53539 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOSBP53539 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOSBP53539 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOSBP53539 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOSBP53539 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOSBP53539 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOSBP53539 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOSBP53539 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOSBP53539 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOSBP53539 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOSBP53539 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FOSBP53539 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FOSBP53539 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FOSBP53539 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FOSBP53539 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FOSBP53539 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FOSBP53539 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
FOSBP53539 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FOSBP53539 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FOSBP53539 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FOSBP53539 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FOSBP53539 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOSBP53539 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOSBP53539 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOSBP53539 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOSBP53539 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOSBP53539 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOSBP53539 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOSBP53539 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOSBP53539 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOSBP53539 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOSBP53539 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOSBP53539 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOSBP53539 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOSBP53539 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
FOSBP53539 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOSBP53539 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOSBP53539 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOSBP53539 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOSBP53539 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOSBP53539 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOSBP53539 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOSBP53539 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOSBP53539 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOSBP53539 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOSBP53539 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOSBP53539 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOSBP53539 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOSBP53539 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOSBP53539 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOSBP53539 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOSBP53539 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOSBP53539 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOSBP53539 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOSBP53539 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOSBP53539 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOSBP53539 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOSBP53539 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOSBP53539 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOSBP53539 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOSBP53539 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOSBP53539 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOSBP53539 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOSBP53539 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOSBP53539 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOSBP53539 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOSBP53539 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOSBP53539 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOSBP53539 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOSBP53539 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOSBP53539 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOSBP53539 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
FOSBP53539 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOSBP53539 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOSBP53539 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOSBP53539 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOSBP53539 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOSBP53539 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms