Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2E1P51965 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms