Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEK4P51957 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEK4P51957 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEK4P51957 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEK4P51957 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEK4P51957 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEK4P51957 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEK4P51957 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEK4P51957 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEK4P51957 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEK4P51957 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEK4P51957 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEK4P51957 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEK4P51957 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEK4P51957 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEK4P51957 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEK4P51957 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEK4P51957 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEK4P51957 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEK4P51957 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEK4P51957 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEK4P51957 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEK4P51957 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEK4P51957 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEK4P51957 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEK4P51957 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEK4P51957 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEK4P51957 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEK4P51957 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NEK4P51957 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEK4P51957 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEK4P51957 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEK4P51957 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEK4P51957 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEK4P51957 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEK4P51957 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEK4P51957 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEK4P51957 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEK4P51957 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEK4P51957 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEK4P51957 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEK4P51957 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEK4P51957 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NEK4P51957 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEK4P51957 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEK4P51957 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEK4P51957 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEK4P51957 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEK4P51957 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEK4P51957 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEK4P51957 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEK4P51957 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEK4P51957 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEK4P51957 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEK4P51957 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEK4P51957 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEK4P51957 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEK4P51957 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEK4P51957 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEK4P51957 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEK4P51957 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEK4P51957 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEK4P51957 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEK4P51957 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEK4P51957 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEK4P51957 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEK4P51957 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NEK4P51957 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
NEK4P51957 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NEK4P51957 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NEK4P51957 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEK4P51957 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEK4P51957 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEK4P51957 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NEK4P51957 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEK4P51957 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEK4P51957 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEK4P51957 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEK4P51957 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEK4P51957 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEK4P51957 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEK4P51957 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEK4P51957 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEK4P51957 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEK4P51957 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEK4P51957 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEK4P51957 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEK4P51957 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEK4P51957 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEK4P51957 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEK4P51957 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEK4P51957 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEK4P51957 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEK4P51957 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEK4P51957 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEK4P51957 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEK4P51957 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEK4P51957 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEK4P51957 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NEK4P51957 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms