Protein–RNA interactions for Protein: P51956

NEK3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK3P51956 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEK3P51956 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEK3P51956 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEK3P51956 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEK3P51956 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEK3P51956 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEK3P51956 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEK3P51956 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEK3P51956 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEK3P51956 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEK3P51956 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NEK3P51956 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK3P51956 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK3P51956 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK3P51956 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK3P51956 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK3P51956 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK3P51956 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK3P51956 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK3P51956 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK3P51956 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK3P51956 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK3P51956 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK3P51956 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK3P51956 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEK3P51956 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEK3P51956 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEK3P51956 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEK3P51956 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NEK3P51956 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEK3P51956 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEK3P51956 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK3P51956 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK3P51956 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK3P51956 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK3P51956 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK3P51956 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK3P51956 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK3P51956 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK3P51956 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK3P51956 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK3P51956 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK3P51956 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK3P51956 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK3P51956 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK3P51956 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK3P51956 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK3P51956 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK3P51956 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK3P51956 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK3P51956 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK3P51956 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK3P51956 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK3P51956 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK3P51956 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEK3P51956 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEK3P51956 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEK3P51956 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEK3P51956 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEK3P51956 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEK3P51956 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEK3P51956 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEK3P51956 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEK3P51956 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEK3P51956 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEK3P51956 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NEK3P51956 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEK3P51956 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEK3P51956 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEK3P51956 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEK3P51956 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEK3P51956 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEK3P51956 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEK3P51956 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEK3P51956 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEK3P51956 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEK3P51956 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NEK3P51956 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEK3P51956 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEK3P51956 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NEK3P51956 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEK3P51956 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEK3P51956 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEK3P51956 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEK3P51956 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEK3P51956 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEK3P51956 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEK3P51956 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEK3P51956 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEK3P51956 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEK3P51956 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEK3P51956 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEK3P51956 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NEK3P51956 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEK3P51956 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEK3P51956 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NEK3P51956 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEK3P51956 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NEK3P51956 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEK3P51956 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms