Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LUMP51884 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LUMP51884 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LUMP51884 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LUMP51884 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LUMP51884 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LUMP51884 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LUMP51884 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LUMP51884 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LUMP51884 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LUMP51884 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LUMP51884 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LUMP51884 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LUMP51884 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LUMP51884 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LUMP51884 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LUMP51884 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LUMP51884 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LUMP51884 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LUMP51884 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LUMP51884 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LUMP51884 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LUMP51884 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LUMP51884 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LUMP51884 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LUMP51884 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LUMP51884 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LUMP51884 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LUMP51884 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LUMP51884 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LUMP51884 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LUMP51884 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LUMP51884 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LUMP51884 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LUMP51884 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LUMP51884 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LUMP51884 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LUMP51884 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LUMP51884 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LUMP51884 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LUMP51884 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LUMP51884 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LUMP51884 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LUMP51884 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LUMP51884 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LUMP51884 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LUMP51884 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LUMP51884 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LUMP51884 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LUMP51884 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LUMP51884 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LUMP51884 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LUMP51884 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LUMP51884 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LUMP51884 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LUMP51884 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LUMP51884 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LUMP51884 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LUMP51884 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LUMP51884 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LUMP51884 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LUMP51884 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LUMP51884 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LUMP51884 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LUMP51884 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LUMP51884 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LUMP51884 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LUMP51884 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
LUMP51884 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LUMP51884 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LUMP51884 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LUMP51884 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LUMP51884 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LUMP51884 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LUMP51884 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LUMP51884 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LUMP51884 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
LUMP51884 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LUMP51884 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LUMP51884 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LUMP51884 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LUMP51884 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LUMP51884 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LUMP51884 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LUMP51884 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LUMP51884 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LUMP51884 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LUMP51884 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LUMP51884 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LUMP51884 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LUMP51884 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
LUMP51884 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
LUMP51884 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LUMP51884 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LUMP51884 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LUMP51884 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LUMP51884 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LUMP51884 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LUMP51884 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LUMP51884 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms