Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRCA2P51587 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
BRCA2P51587 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms