Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAPOLAP51003 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAPOLAP51003 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms