Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSC2P49815 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TSC2P49815 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TSC2P49815 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSC2P49815 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSC2P49815 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSC2P49815 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSC2P49815 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSC2P49815 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSC2P49815 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSC2P49815 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSC2P49815 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSC2P49815 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSC2P49815 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSC2P49815 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSC2P49815 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSC2P49815 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSC2P49815 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSC2P49815 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSC2P49815 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSC2P49815 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSC2P49815 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TSC2P49815 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSC2P49815 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSC2P49815 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSC2P49815 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSC2P49815 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSC2P49815 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSC2P49815 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSC2P49815 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSC2P49815 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSC2P49815 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSC2P49815 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSC2P49815 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSC2P49815 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSC2P49815 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TSC2P49815 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSC2P49815 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSC2P49815 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSC2P49815 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSC2P49815 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSC2P49815 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSC2P49815 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSC2P49815 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSC2P49815 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSC2P49815 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSC2P49815 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSC2P49815 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSC2P49815 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSC2P49815 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSC2P49815 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSC2P49815 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSC2P49815 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSC2P49815 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSC2P49815 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSC2P49815 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSC2P49815 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSC2P49815 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSC2P49815 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSC2P49815 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSC2P49815 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSC2P49815 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSC2P49815 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSC2P49815 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TSC2P49815 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TSC2P49815 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TSC2P49815 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSC2P49815 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSC2P49815 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSC2P49815 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSC2P49815 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSC2P49815 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSC2P49815 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSC2P49815 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSC2P49815 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSC2P49815 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSC2P49815 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSC2P49815 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSC2P49815 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSC2P49815 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSC2P49815 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSC2P49815 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSC2P49815 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSC2P49815 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSC2P49815 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSC2P49815 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TSC2P49815 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSC2P49815 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSC2P49815 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSC2P49815 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSC2P49815 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSC2P49815 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSC2P49815 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSC2P49815 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSC2P49815 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSC2P49815 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSC2P49815 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSC2P49815 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSC2P49815 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSC2P49815 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms