Protein–RNA interactions for Protein: P48723

HSPA13, Heat shock 70 kDa protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA13P48723 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HSPA13P48723 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HSPA13P48723 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HSPA13P48723 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HSPA13P48723 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HSPA13P48723 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HSPA13P48723 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSPA13P48723 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
HSPA13P48723 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSPA13P48723 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSPA13P48723 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSPA13P48723 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSPA13P48723 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSPA13P48723 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSPA13P48723 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSPA13P48723 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms