Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT6CP48668 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT6CP48668 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT6CP48668 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT6CP48668 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT6CP48668 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT6CP48668 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT6CP48668 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT6CP48668 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT6CP48668 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT6CP48668 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT6CP48668 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT6CP48668 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT6CP48668 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT6CP48668 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT6CP48668 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT6CP48668 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT6CP48668 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT6CP48668 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT6CP48668 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT6CP48668 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT6CP48668 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT6CP48668 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT6CP48668 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT6CP48668 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT6CP48668 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT6CP48668 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT6CP48668 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT6CP48668 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT6CP48668 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT6CP48668 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT6CP48668 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT6CP48668 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT6CP48668 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT6CP48668 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms