Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT5P48643 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT5P48643 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT5P48643 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT5P48643 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT5P48643 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT5P48643 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT5P48643 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT5P48643 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT5P48643 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT5P48643 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT5P48643 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT5P48643 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT5P48643 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT5P48643 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT5P48643 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT5P48643 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT5P48643 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT5P48643 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT5P48643 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT5P48643 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT5P48643 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT5P48643 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT5P48643 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT5P48643 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT5P48643 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT5P48643 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT5P48643 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT5P48643 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT5P48643 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT5P48643 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT5P48643 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT5P48643 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT5P48643 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT5P48643 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT5P48643 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT5P48643 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCT5P48643 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCT5P48643 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT5P48643 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT5P48643 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT5P48643 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT5P48643 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT5P48643 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT5P48643 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT5P48643 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT5P48643 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT5P48643 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT5P48643 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT5P48643 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT5P48643 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT5P48643 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT5P48643 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT5P48643 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT5P48643 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT5P48643 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT5P48643 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT5P48643 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT5P48643 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT5P48643 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT5P48643 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT5P48643 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT5P48643 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT5P48643 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT5P48643 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT5P48643 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT5P48643 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT5P48643 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT5P48643 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT5P48643 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT5P48643 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT5P48643 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT5P48643 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT5P48643 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT5P48643 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT5P48643 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT5P48643 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT5P48643 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT5P48643 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT5P48643 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT5P48643 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT5P48643 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT5P48643 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT5P48643 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT5P48643 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT5P48643 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT5P48643 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT5P48643 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT5P48643 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT5P48643 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT5P48643 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT5P48643 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT5P48643 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT5P48643 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT5P48643 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT5P48643 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT5P48643 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT5P48643 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT5P48643 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT5P48643 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms