Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PIP4K2AP48426 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PIP4K2AP48426 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PIP4K2AP48426 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms