Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
UTRNP46939 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
UTRNP46939 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UTRNP46939 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UTRNP46939 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UTRNP46939 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
UTRNP46939 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UTRNP46939 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
UTRNP46939 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UTRNP46939 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UTRNP46939 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UTRNP46939 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UTRNP46939 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UTRNP46939 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UTRNP46939 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UTRNP46939 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UTRNP46939 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UTRNP46939 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
UTRNP46939 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UTRNP46939 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
UTRNP46939 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UTRNP46939 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UTRNP46939 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UTRNP46939 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UTRNP46939 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UTRNP46939 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
UTRNP46939 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UTRNP46939 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UTRNP46939 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UTRNP46939 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
UTRNP46939 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
UTRNP46939 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
UTRNP46939 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UTRNP46939 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UTRNP46939 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UTRNP46939 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
UTRNP46939 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UTRNP46939 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UTRNP46939 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UTRNP46939 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UTRNP46939 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UTRNP46939 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UTRNP46939 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UTRNP46939 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UTRNP46939 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UTRNP46939 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UTRNP46939 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
UTRNP46939 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UTRNP46939 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
UTRNP46939 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
UTRNP46939 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UTRNP46939 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UTRNP46939 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UTRNP46939 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UTRNP46939 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UTRNP46939 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UTRNP46939 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UTRNP46939 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
UTRNP46939 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UTRNP46939 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UTRNP46939 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UTRNP46939 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UTRNP46939 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UTRNP46939 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UTRNP46939 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UTRNP46939 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
UTRNP46939 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UTRNP46939 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UTRNP46939 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UTRNP46939 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UTRNP46939 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UTRNP46939 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UTRNP46939 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UTRNP46939 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
UTRNP46939 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UTRNP46939 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UTRNP46939 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UTRNP46939 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UTRNP46939 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UTRNP46939 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UTRNP46939 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UTRNP46939 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UTRNP46939 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UTRNP46939 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UTRNP46939 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UTRNP46939 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UTRNP46939 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UTRNP46939 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UTRNP46939 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UTRNP46939 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UTRNP46939 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UTRNP46939 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UTRNP46939 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UTRNP46939 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UTRNP46939 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UTRNP46939 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UTRNP46939 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UTRNP46939 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UTRNP46939 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UTRNP46939 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms