Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XCR1P46094 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XCR1P46094 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XCR1P46094 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XCR1P46094 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
XCR1P46094 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XCR1P46094 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
XCR1P46094 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XCR1P46094 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
XCR1P46094 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
XCR1P46094 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XCR1P46094 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XCR1P46094 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XCR1P46094 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XCR1P46094 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XCR1P46094 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XCR1P46094 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XCR1P46094 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XCR1P46094 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XCR1P46094 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XCR1P46094 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XCR1P46094 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XCR1P46094 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XCR1P46094 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XCR1P46094 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XCR1P46094 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XCR1P46094 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XCR1P46094 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
XCR1P46094 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XCR1P46094 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XCR1P46094 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XCR1P46094 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XCR1P46094 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XCR1P46094 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XCR1P46094 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XCR1P46094 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XCR1P46094 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XCR1P46094 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XCR1P46094 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XCR1P46094 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XCR1P46094 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XCR1P46094 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XCR1P46094 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XCR1P46094 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XCR1P46094 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XCR1P46094 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XCR1P46094 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XCR1P46094 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XCR1P46094 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XCR1P46094 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XCR1P46094 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XCR1P46094 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XCR1P46094 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XCR1P46094 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XCR1P46094 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
XCR1P46094 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XCR1P46094 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XCR1P46094 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XCR1P46094 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XCR1P46094 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XCR1P46094 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XCR1P46094 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XCR1P46094 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XCR1P46094 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XCR1P46094 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XCR1P46094 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
XCR1P46094 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XCR1P46094 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XCR1P46094 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XCR1P46094 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XCR1P46094 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XCR1P46094 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XCR1P46094 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XCR1P46094 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XCR1P46094 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XCR1P46094 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XCR1P46094 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
XCR1P46094 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
XCR1P46094 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
XCR1P46094 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XCR1P46094 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XCR1P46094 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XCR1P46094 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XCR1P46094 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XCR1P46094 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
XCR1P46094 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
XCR1P46094 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XCR1P46094 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
XCR1P46094 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
XCR1P46094 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XCR1P46094 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XCR1P46094 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XCR1P46094 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XCR1P46094 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XCR1P46094 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XCR1P46094 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
XCR1P46094 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XCR1P46094 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XCR1P46094 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XCR1P46094 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms