Protein–RNA interactions for Protein: P46019

PHKA2, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, liver isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA2P46019 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PHKA2P46019 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHKA2P46019 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PHKA2P46019 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PHKA2P46019 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHKA2P46019 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHKA2P46019 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHKA2P46019 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHKA2P46019 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHKA2P46019 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHKA2P46019 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHKA2P46019 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHKA2P46019 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHKA2P46019 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHKA2P46019 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHKA2P46019 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHKA2P46019 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHKA2P46019 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHKA2P46019 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PHKA2P46019 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHKA2P46019 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHKA2P46019 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHKA2P46019 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHKA2P46019 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHKA2P46019 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHKA2P46019 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHKA2P46019 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHKA2P46019 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHKA2P46019 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHKA2P46019 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHKA2P46019 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHKA2P46019 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PHKA2P46019 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHKA2P46019 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHKA2P46019 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHKA2P46019 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHKA2P46019 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHKA2P46019 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHKA2P46019 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHKA2P46019 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHKA2P46019 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHKA2P46019 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHKA2P46019 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHKA2P46019 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PHKA2P46019 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHKA2P46019 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHKA2P46019 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms