Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ACADSBP45954 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACADSBP45954 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACADSBP45954 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms