Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP13P45452 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP13P45452 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP13P45452 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP13P45452 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP13P45452 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP13P45452 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP13P45452 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP13P45452 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP13P45452 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP13P45452 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP13P45452 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP13P45452 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP13P45452 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP13P45452 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP13P45452 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP13P45452 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP13P45452 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP13P45452 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP13P45452 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP13P45452 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP13P45452 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP13P45452 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP13P45452 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP13P45452 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP13P45452 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP13P45452 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP13P45452 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP13P45452 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP13P45452 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP13P45452 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP13P45452 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP13P45452 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP13P45452 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP13P45452 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP13P45452 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP13P45452 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP13P45452 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP13P45452 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP13P45452 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP13P45452 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP13P45452 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP13P45452 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP13P45452 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP13P45452 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP13P45452 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP13P45452 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP13P45452 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP13P45452 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP13P45452 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP13P45452 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP13P45452 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP13P45452 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MMP13P45452 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MMP13P45452 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
MMP13P45452 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MMP13P45452 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP13P45452 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP13P45452 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP13P45452 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP13P45452 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP13P45452 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP13P45452 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP13P45452 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP13P45452 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP13P45452 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP13P45452 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP13P45452 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP13P45452 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP13P45452 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP13P45452 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP13P45452 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP13P45452 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP13P45452 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP13P45452 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP13P45452 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP13P45452 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP13P45452 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP13P45452 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP13P45452 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP13P45452 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP13P45452 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP13P45452 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP13P45452 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP13P45452 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP13P45452 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP13P45452 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP13P45452 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP13P45452 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP13P45452 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP13P45452 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP13P45452 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP13P45452 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP13P45452 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP13P45452 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP13P45452 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP13P45452 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP13P45452 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP13P45452 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP13P45452 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms