Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AFMP43652 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AFMP43652 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AFMP43652 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AFMP43652 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AFMP43652 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AFMP43652 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AFMP43652 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AFMP43652 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AFMP43652 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
AFMP43652 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AFMP43652 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AFMP43652 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AFMP43652 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AFMP43652 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AFMP43652 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AFMP43652 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AFMP43652 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
AFMP43652 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AFMP43652 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AFMP43652 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AFMP43652 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AFMP43652 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AFMP43652 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AFMP43652 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AFMP43652 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AFMP43652 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AFMP43652 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AFMP43652 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AFMP43652 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AFMP43652 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AFMP43652 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
AFMP43652 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
AFMP43652 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AFMP43652 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AFMP43652 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AFMP43652 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AFMP43652 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AFMP43652 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFMP43652 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFMP43652 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFMP43652 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFMP43652 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFMP43652 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFMP43652 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFMP43652 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFMP43652 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
AFMP43652 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFMP43652 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFMP43652 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFMP43652 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AFMP43652 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
AFMP43652 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AFMP43652 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AFMP43652 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AFMP43652 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AFMP43652 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AFMP43652 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AFMP43652 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
AFMP43652 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AFMP43652 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AFMP43652 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AFMP43652 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AFMP43652 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AFMP43652 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AFMP43652 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AFMP43652 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AFMP43652 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
AFMP43652 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
AFMP43652 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AFMP43652 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AFMP43652 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AFMP43652 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AFMP43652 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AFMP43652 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AFMP43652 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AFMP43652 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AFMP43652 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AFMP43652 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AFMP43652 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AFMP43652 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AFMP43652 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AFMP43652 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AFMP43652 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AFMP43652 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
AFMP43652 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AFMP43652 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AFMP43652 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AFMP43652 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AFMP43652 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AFMP43652 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AFMP43652 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AFMP43652 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AFMP43652 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AFMP43652 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AFMP43652 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AFMP43652 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFMP43652 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFMP43652 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AFMP43652 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms