Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC1A4P43007 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC1A4P43007 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms