Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PIK3CBP42338 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms