Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTR1BP42025 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTR1BP42025 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTR1BP42025 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTR1BP42025 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTR1BP42025 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTR1BP42025 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTR1BP42025 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTR1BP42025 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTR1BP42025 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTR1BP42025 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTR1BP42025 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTR1BP42025 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTR1BP42025 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTR1BP42025 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTR1BP42025 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTR1BP42025 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTR1BP42025 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTR1BP42025 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTR1BP42025 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTR1BP42025 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTR1BP42025 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTR1BP42025 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms