Protein–RNA interactions for Protein: P41970

ELK3, ETS domain-containing protein Elk-3, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK3P41970 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ELK3P41970 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ELK3P41970 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ELK3P41970 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ELK3P41970 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ELK3P41970 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ELK3P41970 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ELK3P41970 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ELK3P41970 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ELK3P41970 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ELK3P41970 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ELK3P41970 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ELK3P41970 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ELK3P41970 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ELK3P41970 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ELK3P41970 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ELK3P41970 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ELK3P41970 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ELK3P41970 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ELK3P41970 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ELK3P41970 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ELK3P41970 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ELK3P41970 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ELK3P41970 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ELK3P41970 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ELK3P41970 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ELK3P41970 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ELK3P41970 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ELK3P41970 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ELK3P41970 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ELK3P41970 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ELK3P41970 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELK3P41970 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELK3P41970 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELK3P41970 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELK3P41970 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELK3P41970 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELK3P41970 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELK3P41970 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELK3P41970 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELK3P41970 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELK3P41970 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELK3P41970 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELK3P41970 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELK3P41970 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELK3P41970 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELK3P41970 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELK3P41970 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELK3P41970 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELK3P41970 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ELK3P41970 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ELK3P41970 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ELK3P41970 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ELK3P41970 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ELK3P41970 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ELK3P41970 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ELK3P41970 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ELK3P41970 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ELK3P41970 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ELK3P41970 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ELK3P41970 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ELK3P41970 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ELK3P41970 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ELK3P41970 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ELK3P41970 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ELK3P41970 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ELK3P41970 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ELK3P41970 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ELK3P41970 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ELK3P41970 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ELK3P41970 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ELK3P41970 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ELK3P41970 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ELK3P41970 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ELK3P41970 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ELK3P41970 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ELK3P41970 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ELK3P41970 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ELK3P41970 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ELK3P41970 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ELK3P41970 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ELK3P41970 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ELK3P41970 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ELK3P41970 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ELK3P41970 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ELK3P41970 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ELK3P41970 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ELK3P41970 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ELK3P41970 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ELK3P41970 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ELK3P41970 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ELK3P41970 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ELK3P41970 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ELK3P41970 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ELK3P41970 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ELK3P41970 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ELK3P41970 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ELK3P41970 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ELK3P41970 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ELK3P41970 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms