Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFSF9P41273 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFSF9P41273 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFSF9P41273 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFSF9P41273 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFSF9P41273 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFSF9P41273 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFSF9P41273 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFSF9P41273 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFSF9P41273 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFSF9P41273 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFSF9P41273 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFSF9P41273 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFSF9P41273 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFSF9P41273 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFSF9P41273 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFSF9P41273 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFSF9P41273 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFSF9P41273 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFSF9P41273 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFSF9P41273 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFSF9P41273 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFSF9P41273 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFSF9P41273 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFSF9P41273 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFSF9P41273 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFSF9P41273 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFSF9P41273 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFSF9P41273 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFSF9P41273 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFSF9P41273 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms