Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM5CP41229 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5CP41229 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms