Protein–RNA interactions for Protein: P38646

HSPA9, Stress-70 protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA9P38646 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSPA9P38646 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSPA9P38646 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSPA9P38646 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSPA9P38646 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA9P38646 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA9P38646 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA9P38646 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA9P38646 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA9P38646 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA9P38646 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA9P38646 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA9P38646 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA9P38646 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA9P38646 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA9P38646 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA9P38646 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA9P38646 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA9P38646 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA9P38646 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HSPA9P38646 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HSPA9P38646 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSPA9P38646 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSPA9P38646 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSPA9P38646 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSPA9P38646 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPA9P38646 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPA9P38646 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPA9P38646 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPA9P38646 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPA9P38646 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPA9P38646 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPA9P38646 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms