Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ETFBP38117 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ETFBP38117 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ETFBP38117 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ETFBP38117 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ETFBP38117 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ETFBP38117 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ETFBP38117 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ETFBP38117 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ETFBP38117 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ETFBP38117 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ETFBP38117 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ETFBP38117 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ETFBP38117 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ETFBP38117 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ETFBP38117 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ETFBP38117 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ETFBP38117 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ETFBP38117 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ETFBP38117 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ETFBP38117 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ETFBP38117 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ETFBP38117 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ETFBP38117 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ETFBP38117 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ETFBP38117 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ETFBP38117 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ETFBP38117 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ETFBP38117 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ETFBP38117 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ETFBP38117 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ETFBP38117 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ETFBP38117 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ETFBP38117 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ETFBP38117 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ETFBP38117 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ETFBP38117 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ETFBP38117 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ETFBP38117 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ETFBP38117 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ETFBP38117 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ETFBP38117 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ETFBP38117 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ETFBP38117 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ETFBP38117 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ETFBP38117 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ETFBP38117 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ETFBP38117 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ETFBP38117 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ETFBP38117 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ETFBP38117 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ETFBP38117 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ETFBP38117 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ETFBP38117 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ETFBP38117 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ETFBP38117 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ETFBP38117 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ETFBP38117 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ETFBP38117 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ETFBP38117 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ETFBP38117 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ETFBP38117 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ETFBP38117 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ETFBP38117 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ETFBP38117 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ETFBP38117 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ETFBP38117 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ETFBP38117 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ETFBP38117 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ETFBP38117 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ETFBP38117 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ETFBP38117 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ETFBP38117 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ETFBP38117 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ETFBP38117 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ETFBP38117 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ETFBP38117 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ETFBP38117 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ETFBP38117 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ETFBP38117 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ETFBP38117 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ETFBP38117 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ETFBP38117 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ETFBP38117 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ETFBP38117 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ETFBP38117 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ETFBP38117 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ETFBP38117 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ETFBP38117 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ETFBP38117 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ETFBP38117 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ETFBP38117 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ETFBP38117 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ETFBP38117 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ETFBP38117 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ETFBP38117 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ETFBP38117 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ETFBP38117 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ETFBP38117 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ETFBP38117 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms