Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNCAP37840 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNCAP37840 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNCAP37840 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNCAP37840 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCAP37840 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCAP37840 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCAP37840 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCAP37840 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCAP37840 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCAP37840 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCAP37840 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCAP37840 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCAP37840 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCAP37840 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCAP37840 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCAP37840 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCAP37840 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNCAP37840 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNCAP37840 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNCAP37840 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNCAP37840 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNCAP37840 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNCAP37840 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNCAP37840 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNCAP37840 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNCAP37840 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNCAP37840 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCAP37840 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCAP37840 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCAP37840 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCAP37840 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCAP37840 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCAP37840 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCAP37840 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCAP37840 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCAP37840 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCAP37840 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCAP37840 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCAP37840 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCAP37840 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCAP37840 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCAP37840 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCAP37840 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCAP37840 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCAP37840 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNCAP37840 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCAP37840 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCAP37840 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCAP37840 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCAP37840 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCAP37840 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCAP37840 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCAP37840 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCAP37840 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCAP37840 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCAP37840 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCAP37840 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCAP37840 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNCAP37840 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCAP37840 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCAP37840 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCAP37840 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCAP37840 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCAP37840 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCAP37840 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCAP37840 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCAP37840 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCAP37840 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCAP37840 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCAP37840 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCAP37840 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNCAP37840 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCAP37840 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCAP37840 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCAP37840 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCAP37840 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCAP37840 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCAP37840 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCAP37840 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCAP37840 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCAP37840 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCAP37840 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCAP37840 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCAP37840 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCAP37840 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCAP37840 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCAP37840 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNCAP37840 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SNCAP37840 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SNCAP37840 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNCAP37840 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNCAP37840 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SNCAP37840 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNCAP37840 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNCAP37840 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNCAP37840 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SNCAP37840 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNCAP37840 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNCAP37840 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms