Protein–RNA interactions for Protein: P37235

HPCAL1, Hippocalcin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL1P37235 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPCAL1P37235 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPCAL1P37235 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
HPCAL1P37235 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HPCAL1P37235 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
HPCAL1P37235 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
HPCAL1P37235 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HPCAL1P37235 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPCAL1P37235 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPCAL1P37235 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HPCAL1P37235 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPCAL1P37235 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPCAL1P37235 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPCAL1P37235 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HPCAL1P37235 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HPCAL1P37235 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HPCAL1P37235 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HPCAL1P37235 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPCAL1P37235 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPCAL1P37235 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HPCAL1P37235 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HPCAL1P37235 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPCAL1P37235 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HPCAL1P37235 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
HPCAL1P37235 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPCAL1P37235 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPCAL1P37235 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HPCAL1P37235 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HPCAL1P37235 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
HPCAL1P37235 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPCAL1P37235 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPCAL1P37235 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HPCAL1P37235 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPCAL1P37235 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HPCAL1P37235 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPCAL1P37235 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPCAL1P37235 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPCAL1P37235 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HPCAL1P37235 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPCAL1P37235 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPCAL1P37235 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPCAL1P37235 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPCAL1P37235 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPCAL1P37235 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HPCAL1P37235 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPCAL1P37235 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPCAL1P37235 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HPCAL1P37235 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HPCAL1P37235 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HPCAL1P37235 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPCAL1P37235 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HPCAL1P37235 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPCAL1P37235 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPCAL1P37235 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPCAL1P37235 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPCAL1P37235 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPCAL1P37235 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPCAL1P37235 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
HPCAL1P37235 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPCAL1P37235 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPCAL1P37235 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPCAL1P37235 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPCAL1P37235 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HPCAL1P37235 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPCAL1P37235 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPCAL1P37235 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPCAL1P37235 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPCAL1P37235 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPCAL1P37235 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPCAL1P37235 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPCAL1P37235 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPCAL1P37235 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HPCAL1P37235 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPCAL1P37235 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPCAL1P37235 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPCAL1P37235 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HPCAL1P37235 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPCAL1P37235 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HPCAL1P37235 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPCAL1P37235 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPCAL1P37235 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPCAL1P37235 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPCAL1P37235 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPCAL1P37235 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPCAL1P37235 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPCAL1P37235 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPCAL1P37235 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPCAL1P37235 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPCAL1P37235 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPCAL1P37235 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPCAL1P37235 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPCAL1P37235 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPCAL1P37235 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HPCAL1P37235 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPCAL1P37235 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPCAL1P37235 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPCAL1P37235 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPCAL1P37235 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPCAL1P37235 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPCAL1P37235 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms