Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBRP36941 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBRP36941 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBRP36941 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBRP36941 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBRP36941 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBRP36941 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBRP36941 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBRP36941 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTBRP36941 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTBRP36941 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTBRP36941 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTBRP36941 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTBRP36941 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTBRP36941 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTBRP36941 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTBRP36941 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTBRP36941 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBRP36941 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBRP36941 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBRP36941 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBRP36941 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBRP36941 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBRP36941 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBRP36941 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBRP36941 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBRP36941 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBRP36941 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBRP36941 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBRP36941 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBRP36941 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBRP36941 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBRP36941 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBRP36941 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBRP36941 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBRP36941 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBRP36941 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBRP36941 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBRP36941 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBRP36941 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBRP36941 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBRP36941 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBRP36941 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBRP36941 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBRP36941 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBRP36941 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBRP36941 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBRP36941 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LTBRP36941 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBRP36941 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBRP36941 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBRP36941 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBRP36941 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBRP36941 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBRP36941 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBRP36941 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBRP36941 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBRP36941 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBRP36941 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBRP36941 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBRP36941 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBRP36941 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBRP36941 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBRP36941 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBRP36941 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBRP36941 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBRP36941 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBRP36941 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBRP36941 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBRP36941 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBRP36941 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBRP36941 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBRP36941 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBRP36941 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBRP36941 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBRP36941 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBRP36941 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBRP36941 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBRP36941 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBRP36941 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBRP36941 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBRP36941 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBRP36941 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBRP36941 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBRP36941 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBRP36941 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBRP36941 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBRP36941 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBRP36941 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBRP36941 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBRP36941 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBRP36941 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBRP36941 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBRP36941 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBRP36941 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBRP36941 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBRP36941 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBRP36941 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBRP36941 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBRP36941 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms